Hortus Alkmaar beheert een collectie van meer dan 800 soorten planten die historisch en actueel gebruikt worden voor medische toepassing, dan wel de basis vormden voor moderne syntheses.
De plantaardige bronnen van veel van onze huidige geneesmiddelen zijn een belangrijk erfgoed van de medische ontwikkeling en onze cultuur, dat in zijn pure vorm in stand gehouden dient te worden.
Van oudsher vormen horti een bron van kennis voor (aankomend) artsen en apothekers. In Alkmaar was al in 1772 een hortus medicus gevestigd.